ปลาหมึกยักษ์สามารถนำมาปรุงเป็นเมนูอาหารได้ค่อนข้างหลากหลายและค่อนข้างง่ายในการปรุง โดยอาจใช้วิธีต้ม ย่าง หรือทำให้สุกในน้ำ (Poach) การปรุงจะเกี่ยวข้องกับการทำให้นุ่ม นั่นคือการปรุงโดยใช้แรงดัน การปรุงสุกในน้ำที่ใช้เวลานานขึ้นที่ความร้อนต่ำ การใช้ค้อนทุบหรือนวดด้วยเกลือ หลังจากขั้นตอนนี้ สามารถตัดปลาหมึกยักษ์ออกเป็นชิ้น อาจทำการย่างเพื่อเพิ่ทรสชาติและเสิร์ฟพร้อมข้าวหรือสลัด อย่าปรุงให้สุกจนเกินไป
เก็บปลาหมึกยักษ์สดไว้ในตู้เย็นโดยใส้ไว้ในภาชนะที่ปิดสนิท และควรนำมาปรุงอาหารภายในวันที่ซื้อมา หรือหากแช่แข็งจะเก็บได้นานถึงสองเดือน หากมีปลาหมึกยักษ์ที่ปรุงแล้วที่เหลือให้เก็บไว้ในภาชนะที่ปิดสนิทในตู้เย็น และควรใช้ภายใน 3 วัน